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科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了一種沒有可識別基因的病毒,使其成為所有已知病毒中最奇怪的一種
來源:《中國科學(xué)報》 2020-02-12 13:45:20

Yaravirus(暗斑)感染阿米巴蟲。圖片來源:MICROSCOPY CENTER UFMG-BELO HORIZONTE

病毒是地球上最神秘的生物之一。它們是世界上最小的生命形式,由于沒有宿主就無法生存和繁殖,一些科學(xué)家質(zhì)疑它們是否應(yīng)該被視作生物。

據(jù)《科學(xué)》雜志報道,現(xiàn)在,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了一種沒有可識別基因的病毒,使其成為所有已知病毒中最奇怪的一種。同時,另一個研究小組日前在幾十種動物的組織中發(fā)現(xiàn)了數(shù)千種新病毒。

巴西米納斯聯(lián)邦大學(xué)病毒學(xué)家J?觝natas Abrah?觔o是研究者之一。他表示,這些發(fā)現(xiàn)表明關(guān)于病毒“我們還有很多需要了解”。

Abrah?觔o是在搜尋巨大病毒時有了這一發(fā)現(xiàn)的。細(xì)菌大小的巨大病毒于2003年首次在阿米巴蟲中被找到。在當(dāng)?shù)匾粋€人工湖中,Abrah?觔o和同事不僅發(fā)現(xiàn)了新的巨大病毒,還找到了另一種病毒,這種病毒體積小,不同于大多數(shù)感染阿米巴蟲的病毒,研究者將其命名為Yaravirus。

Yaravirus的大小并不是唯一奇怪的地方。研究小組在bioRxiv預(yù)印本服務(wù)器上報告說,當(dāng)研究人員對其基因組進(jìn)行測序時,發(fā)現(xiàn)沒有一個基因與之前科學(xué)家遇到的相匹配。

在廢水和呼吸系統(tǒng)中搜尋病毒的美國紐約大學(xué)的Elodie Ghedin對這種病毒并不感到驚訝。她說,污水?dāng)?shù)據(jù)中超過95%的病毒“與數(shù)據(jù)庫中的參考基因組不匹配”。“我們似乎一直在發(fā)現(xiàn)新病毒。”

Abrah?觔o說,一些Yaravirus的基因看起來像是巨型病毒的基因,但目前還不清楚這兩者間的關(guān)系。他和同事仍在研究這種新型病毒生活方式的其他方面。

當(dāng)Abrah?觔o追蹤病毒時,美國國立癌癥研究所病毒學(xué)家Christopher Buck和研究生Michael Tisza正在撒下一張更廣闊的網(wǎng)。他們廣泛地在動物組織中尋找能使自身遺傳物質(zhì)呈環(huán)形的病毒。所謂的環(huán)狀病毒包括乳頭瘤病毒,其中一種是可引起宮頸癌的人乳頭瘤病毒。

為找到這些病毒,研究人員從人類和其他動物的數(shù)十個組織樣本中分離出病毒顆粒,并對它們進(jìn)行環(huán)狀基因組篩選。通過尋找一種能編碼病毒外殼的基因,研究人員確認(rèn)了DNA屬于病毒。這些基因序列往往無法識別,但Tisza編寫了一個計算機(jī)程序,預(yù)測哪些基因最有可能編碼這些外殼的獨(dú)特褶皺。

研究小組總共發(fā)現(xiàn)了約2500種環(huán)狀DNA病毒,其中大約600種是新發(fā)現(xiàn)的。研究小組在eLife上報告說,目前還不清楚這些微生物對人類健康有什么影響。但Buck 說,這些數(shù)據(jù)應(yīng)該可以讓醫(yī)生和科學(xué)家建立這種聯(lián)系。Abrah?觔o說,這種方法“是了解成百上千個病毒基因組分布的重要工具”。

這項新研究的意義不僅在于找出哪些病毒會導(dǎo)致疾病。一些人體內(nèi)的病毒可能有助于人們保持健康,而另一些病毒則有助于循環(huán)利用必要的營養(yǎng),保持生態(tài)系統(tǒng)的平穩(wěn)運(yùn)行。“沒有它們,我們無法生存。”未參與任何一項研究的加拿大溫哥華不列顛哥倫比亞大學(xué)環(huán)境病毒學(xué)家Curtis Suttle說,“發(fā)現(xiàn)和鑒定病毒有巨大的好處。”(文樂樂)

關(guān)鍵詞: 可識別基因 病毒
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