人工智能已經深度進入基因和蛋白質領域,這既是醫(yī)療、藥物和生命科學與AI聯(lián)姻的一種突破,也意味著AI在維護人們健康、延長壽命和提高生命質量方面有了穩(wěn)步進展。
谷歌最新人工智能軟件阿爾法折疊(Alpha Fold),在一項極其困難的任務中擊敗了所有對手,成功根據基因序列預測了生命基本分子——蛋白質的三維結構。
這意味著,人工智能已經深度進入基因和蛋白質領域,這既是醫(yī)療、藥物和生命科學與AI聯(lián)姻的一種突破,也表明AI在維護人們健康、延長壽命和提高生命質量方面有了穩(wěn)步進展。
阿爾法折疊是被設計來解析蛋白質折疊的。生物體和人體擁有著各種各樣的蛋白質,它們承擔著身體各種復雜且重要的功能,從食物消化到免疫抗病,從感覺到運動功能等,都離不開蛋白質。
一個簡單的蛋白質往往包含了數(shù)百個氨基酸,其空間結構的可能性就高達10的300次方個。不只是蛋白質中氨基酸序列決定生命現(xiàn)象和疾病,而且蛋白質的空間結構同樣決定生理功能和疾病,只要蛋白質的結構發(fā)生一點錯誤,就會誘發(fā)和導致各種疾病,如糖尿病、帕金森癥和阿爾茨海默癥等。
也因此,解析蛋白質結構已成為基因測序后,診斷疾病、研發(fā)新藥和深入理解生命現(xiàn)象的一把重要鑰匙。阿爾法折疊通過人工智能算法,在去年底的一項有98名參賽者參加的解析蛋白質結構的競賽中贏得第一名,獲得了43種蛋白中的25種蛋白結構的最高分,排名第二的隊伍只有其中3個獲得了預測最高分。
這說明,阿爾法折疊在解析和預測蛋白質結構上比較準確。這也昭示著,對疾病的診斷和研發(fā)新藥有了新的利器。
以阿爾法折疊為代表的AI不只是可以既快又準確地分析已知的一些蛋白質的三維結構,還能預測和發(fā)現(xiàn)人們尚未知曉的蛋白質結構。
不過,阿爾法折疊的最大進步是通過算法來找到蛋白質的三維形狀。一段基因序列(DNA片段)只構成了氨基酸按一定序列排成的長鏈,僅僅靠基因測序是無法獲知蛋白質結構的,這就需要阿爾法折疊以算法來確認蛋白質的三維結構。
從理論上分析,能夠分析和預測蛋白質的形狀和結構,就能夠更好地確定其他分子與蛋白質結合的方式,也就可能研發(fā)新的藥物,因為藥物是在人體內與特殊的蛋白質結合并改變蛋白質的活動方式而發(fā)揮藥效的。從這個意義上來看,阿爾法折疊能解析蛋白質折疊問題,也僅僅是一個新的開端,要研發(fā)出新藥或產生新的治療疾病的方式,還有很長的路要走。
當然,阿爾法折疊和其他AI技術都主要是通過算法來理解疾病和改進藥物治療的效果,預測和分析蛋白質折疊尚不能解決蛋白質折疊問題。因此,現(xiàn)階段比阿爾法折疊走得更遠和應用得更成熟的是讓AI軟件診斷疾病,如癌癥。
當阿爾法折疊和其他AI技術能診斷疾病,確定病因時,就可以既采用新的療法,如基因療法,修改和刪除致病基因,進而讓返老還童成為可能,又有可能研發(fā)出針對蛋白質三維結構的新藥來治療疾病。現(xiàn)在,人工智能介入醫(yī)學和生命科學才只是開始。(張?zhí)锟?
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